我阅读pdf文档，主要用的是paperpile文献管理工具。该app可以自动将标记的部分输出为笔记（readcube也有此功能）。

对我来说最重要的就是 url 的链接（语法是 [内容](url)）来链接 pdf 的页面，以及笔记之间的页面链接（[[笔记名称]]）。有了它们就可以实现笔记和原文之间的跳转，笔记之间的跳转。值得一提的是，DEVONthink 为每一个文件，乃至 pdf 中的每一个页面生成一个 url，只要在页面上右键复制 url 链接并粘贴到笔记中，就完成了原文的链接引用。因此我们需要的就是从 DEVONthink 里打开已经读完第一遍的 pdf，同时打开 Obsidian 在其中做笔记。我称之为第二遍阅读和整理。

缺点：扫描版的竖排版书籍 OCR 之后也很难拽出文字来，而且拖拽出来的的笔记卡片没有 url 链接。

能同时完成管理、查询、OCR、提供 pdf 页面链接功能，而且一次付费终身使用的全能工具

我设想的工作流应该是这样：工作流从阅读材料的电子化管理开始，新的材料扫描成电子版后，进入我的个人图书馆管理系统进行 OCR 识别成文字版，进行分类保存。近期需要读的材料从个人图书馆管理系统取出，暂存入借阅站（这一功能云盘就可以担当，我使用的是 Dropbox），方便在各个平台（ipad，电纸书，电脑）进行阅读。第一遍阅读将重点进行高亮标记，传回管理系统的待整理区，等待下一步处理。接下来在电脑上做笔记。打开读过一遍的 pdf，同时打开笔记软件。对材料进行第二遍阅读和整理，只看标注过的地方，用自己的语言整理笔记。遇到重点或者想要日后引用的部分，应该能将 pdf 页面链接到笔记中，日后查阅时点击链接就能回到原文。整理好笔记的 pdf 材料可以回到图书馆管理系统的保存区进行存档。不断循环重复上述步骤，读很多书，积攒很多读书笔记。接下来就是在笔记系统里玩耍，随机回顾做好的笔记，如果有新的发现可以添加卡片式笔记贴到读书笔记里，对自己的想法和书中的想法进行区分。而且相关的笔记之间应该可以进行链接，容纳我的发散式思维。笔记变多了，应该能成为一个知识网络，最好能够直观地把知识网络地图提供出来。最后一步是知识输出。有了新发现就可以进行写作了。这时需要方面地找到相关的笔记和参考资料，基于已有的卡片笔记梳理大纲。短文写作可以一气呵成，但长文每次可能只能写出一个小节，那么需要一个可以以小节为单位的写作工具，并且提供整体的大纲视图且能方便地随时调整大纲顺序，最后简单地合成一整篇文章。

九、图文版PDF应结合abbyy finereader 15使用因为liquidtext没有文字识别功能，如果是图文版pdf强烈建议使用abbyy finereader 15文字识别保存后再导入liquidtext使用！这样你就无需用笔、鼠标、手绘板一次一次的框选上下行文字，可以直接选取文字，如何使用abbyy finereader 15见上图，

它的便签式的整理方法是导图也可以不是导图，操作起来极为自然流畅，这是其它软件无法比拟的!，缺点是无法把黏贴在一起分类好的便签收缩（无法收缩便签）和没有便签自动排序如果读大书整理起来会比较痛苦，这样如果是读大书你要往某一处已经有很多便签的地方添加便签就必须整理非常多非常多的便签的腾出空间来，如果为了这个地方的空间就要腾挪整个大图上的便签那一定很要命（我就这么干过），虽然能框选一次就挪一大块，但还是觉得缺少些功能并不适合读太大的书，其官网有用户评价适合用来读大pdf我不知道那用户是如何进行的。 对中文的支持也不大好劝退了一部分人。

访问该工具页面后，在左上角的「User」框中填入自己的 Hypothesis 用户名，并在左下角的「Hypothesis API token」框中填入之前生成的 API token，然后根据需要填写其他检索条件（留空则默认显示近期批注页面），就可以在页面右侧看到实时更新的检索结果。如果需要批量导出，可以点击「CSV」或「JSON」按钮获得相应格式的数据，然后用 Excel 等工具进一步处理即可。