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  1. Last 7 days
    1. RNA-seq到底是什么?就是转录本吗?就是指细胞在某一状态、某一时刻,所有转录出来的基因的转录情况?讲生物学重复、批次、测序深度、spike in是为何?要详细了解转录组分析的基础流程。

      分清转录组、RNA-seq、转录本 mRNA的结构是否是重要的? nucleus mRNA-seq与 cytoplasm mRNA-seq有什么不同? RNA-seq的主要研究目的?各个层面的详细解释。 实验设计与建库的流程知识点,最好辅以一个具体、超详细的例子进行介绍。 转录组分析的比对、质控与挑战

      转录组的组装与基因组的组装比较?

    1. 当细胞死亡发生时,基因表达、蛋白水平、代谢物、信号通路都会变化。多组学就是从多个层面看细胞状态。 比如 RNA-seq 看哪些基因表达变了;蛋白组看哪些蛋白变了;代谢组看哪些代谢物变了。综合起来,才能更完整地理解细胞为什么走向死亡。

      感觉也很命苦。是不是之前测试的每个药物的结果,都得这样分析一遍,然后比对。

    2. CRISPR筛选

      crispr-cas9我知道,是分子剪刀。这个筛选系统我没听说过,不过我猜测就是说哪些基因被剪掉后,对这个细胞死亡过程及结果的影响吧。但是基因组这么多,这样做不是很慢吗?具体如何执行?原理为何?

    3. 因为某些癌细胞对铁死亡很敏感

      看来机体的铁离子过量是引发铁死亡的原因之一,脂质过氧化、氧化应激我不太懂。不过是不是补充多一点铁离子就不容易有癌症了呢?以及铁死亡的分子机制是?人类要什么样的活动容易使细胞发生铁死亡?

    4. 坏死性凋亡

      坏死性凋亡跟焦亡的区别是在于:前者出现的时机是机体遭遇感染时,是有意义的细胞死亡、炎症因子释放;后者则是细胞凋亡出问题了,而发生的意外现象。可以这样理解吗?目前我认为细胞焦亡跟坏死性凋亡的细胞表征都是一样的,这样是对的吗?以及我想知道他们的诱因及分子机制都是因为什么。

    5. 比如一个 DNA 严重损伤的细胞,如果它不凋亡,就可能变成癌细胞。所以凋亡是身体防癌的重要机制。很多抗癌药,本质上就是想重新启动癌细胞的凋亡程序。 但癌细胞很狡猾。它们常常通过突变、信号通路异常等方式逃避凋亡,于是就“该死不死”。

      原来如此!癌细胞太坏了!所以如果想办法把命运转向凋亡,也是通过分子机制来调控吧

    1. 药物代谢酶与药物解毒机制

      药物代谢酶就是帮助药物进行化学改造,使之更容易排除体外的一系列关键酶系,比如cyp450、ugt等等。药物的解毒机制其实就是一项代谢、二项代谢机制。前者把药物水解、氧化、还原,改变药物化学结构,后者通过结合,给药物打上标签,使之更容易排出体外。

    2. EC/ED50,LC/LD50,LOEC/NOEC

      ec/ed50:ec50是半数最大效应浓度,指的是打到最大效应百分之五十的药物浓度。ed50是半数有效剂量,指的是百分之五十个体能产生预期效应的剂量,或者效应达到ec50浓度的剂量。 lc/ld50:lc50是半数致死浓度,也就是一定时间内导致50%实验动物死亡的浓度。ld50是半数致死剂量,也就是打到上述目的需要的剂量。 loec是最低可观察效应浓度,也就是与对照组相比,开始产生明显效应的最低浓度。noec是无可观察效应浓度,也就是跟对照组相比,没有产生效应的最高浓度。

    3. 药物代谢的 ADME

      即吸收、分布、代谢、排泄。 影响吸收的因素主要有给药方式和药物的理化性质。不同的给药部位药物吸收的程度也不一样。分子量大小亦会影响吸收程度。除此之外,还有食物影响、剂型、胃肠的ph值等等因素。 分布是指药物扩散到达体内各个细胞的过程。药物本身的脂溶性越高,越容易穿过细胞膜进入细胞。除此之外,与血浆白蛋白的结合率也会影响药物的分布。亲和率越高的越不容易形成游离形药物,容易到肝脏集中储存,缓慢长期释放。 还有各种生物屏障也会阻挠药物的分布,比如血脑屏障、胎盘屏障、血眼屏障等等。 代谢前面讲了。 排协是指药物排除的过程,通常经过肾脏随着尿液排出。但是也可以通过粪便、胆汁、汗液、呼吸道、乳汁等途径排除。

    4. PK/PD 的药理学含义

      pk即药物代谢动力学,反应机体怎么处理药物,即药物-时间的关系。药物进入体内后怎么吸收、分布、代谢、排泄,多久到达浓度峰值、多久开始减少、排完要多少时间。 pd即药物效应动力学,反应药物怎么对身体有反应,即药物浓度-效应曲线。药物进入体内后肿瘤细胞死多少、体温变化如何、各个检测水平怎么样。

    5. Biomarker and/or Target 的概念

      即生物标志物与靶点。生物标志物就是可以反映治疗效果、毒性效果、生理变化的一种分子、蛋白、酶、核酸等等,可以检测的指标。比如糖尿病中,血糖就可以作为生物标志物,给我们提供治疗情况。target即靶点,通常是药物直接作用的分子,可以是一种酶、蛋白、抗原、核酸或离子通道等等。当然,有些分子既可以是生物标志物,也可以是靶点。

    6. 药物代谢的概念

      药物代谢什么概念;功能是什么:脂溶性、水溶性;发生场所、酶;代谢类型;灭活、活化、化学变构