转录组
mRNA转录组
转录组
mRNA转录组
目标基因序列信息
目标基因序列突变信息
Editor
prime editing
生物安全性评价
这段问题较大 首先RNA脱靶的话一般个体水平不检测,我建议是不太讲这个(要讲的话我得考虑下怎么评估好一些),下面是我改的这块。 基于 CRISPR/Cas9 系统衍生的各类编辑工具在编辑过程中可能会产生脱靶效应,即在非目标位点引入碱基变化。因此,通过全基因组脱靶位点查找及重测序方法进行检测是目前公认的脱靶效应检测方法。通过生物信息学方法对全基因组进行遍历搜寻脱靶位点,或是比对获得全基因组范围内新发突变发生位置和发生频率,分析编辑技术本身是否引起基因组上的有害变异,特别是结构变异的发生,系统性评估基因编辑山羊的生物安全性。
GO 或 KEGG 进行功能富集分析
利用相关数据库对基因功能及基因通路进行富集分析
plink/
EMMAX/TASSEL/FastLMM
Admixture
Admixture软件
遗传距离
这不能叫遗传距离,叫类群差异更合适点
育种潜力安全性
育种潜力及安全性
Indel
InDel
序列信息
及突变类型