- Dec 2018
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www.bmbf.de www.bmbf.de
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Bei Verbundprojekten ist eine Skizze in Abstimmung aller Beteiligten durch den vorgesehenen Verbundkoordinator vorzulegen. Der schriftlich eingereichten Skizze ist ein Anschreiben/Vorblatt zur Einreichung beizulegen, auf dem die einreichende Institution (bei Verbünden die gesammelten Anschreiben der koordinierenden Institution sowie aller Verbundpartner) mittels rechtsverbindlicher Unterschrift im Original (in der Regel der Kanzler oder Rektor) die Kenntnisnahme sowie die Richtigkeit der in der Skizze gemachten Angaben bestätigt.
De facto vor Weihnachten zur Institutsleitung.
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Aussagen zur Generalisierbarkeit
wurde das Carpentries-Konzept schon: https://datacarpentry.org/lessons/ "Eco, Geo, Social"
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Ausführliche Darstellung des hochschuldidaktischen und medienpädagogisch begründeten, digitalen Fachkonzepts unter Berücksichtigung der jeweiligen Fachkultur
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Beschreibung des methodischen Vorgehens und gegebenenfalls der interdisziplinären Zusammenarbeit
Carpentries: Live-Programmierung auf eigenen Rechnern => Setup sofort für eigene Projekte nutzbar
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Stiftungen, Fakultätentage etc.) können nur dann gefördert werden, wenn sie Teil eines von einer Hochschule koordinierten Verbundprojekts
Bedeutet dies, dass TIB nur als Partner von IDN, LUH o.Ä. teilnehmen kann? VDB (wegen https://hypothes.is/a/cThlJPlXEeieD98pX3vKfA) ist ein Verein.
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Daten aufbereitet und dokumentiert an ein geeignetes Forschungsdatenzentrum zu übergeben
- [ ] Zenodo?
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Stiftungen, die von Bund und/oder Ländern grundfinanziert werden, können neben ihrer institutionellen Förderung nur unter bestimmten Voraussetzungen eine Projektförderung für ihre zusätzlichen projektbedingten Ausgaben beziehungsweise Kosten bewilligt werden. Zu den Bedingungen, wann staatliche Beihilfe vorliegt/nicht vorliegt, und in welchem Umfang beihilfefrei gefördert werden kann, siehe Mitteilung der Kommission zum Unionsrahmen für staatliche Beihilfen zur Förderung von Forschung, Entwicklung und Innovation vom 27. Juni 2014 (ABl. C 198 vom 27.6.2014, S. 1); insbesondere Abschnitt 2.
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einen plausiblen Entwicklungs- und Erprobungsplan der Konzepte
https://hypothes.is/a/wq84XvlZEeij1oNCA-bWvQ als Vorteil darstellen, wenn Anschlussförderung (ab SoSe 2020) möglich ist
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zukünftigen Forschungs- oder Arbeitstätigkeiten
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Disziplinen, die spezifische Lehr-/Lernformen oder Forschungsmethoden ihrer Disziplin mit digitalen Medien unterstützen wollen (z. B. Laborpraktika oder Nutzung von Fallrepositorien)
Notwendigkeit, Datenauswertungen selbst zu programmieren
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kompetenzorientierte Prüfungsformate individualisierte, adaptive Prüfungsformate
Noch große Lücke bei Carpentries: Abschlussprüfungsformate.
Teilweise https://lab.github.com/courses möglich, oder https://education.github.com/, aber wie dann Freiwilligkeit & Datenschutz gegenüber US-Konzenr wahren?
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Aufbau von Weiterbildungs- oder Beratungsstrukturen für Lehrende
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weder Technik noch Tools neu erforscht oder neu entwickelt
Nein, etablierte Standardwerkzeuge aus FLOSS, Industrie & Akademie
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selbstbestimmtes Lernen
OERs = Möglichkeit für flipped classroom, siehe auch https://hypothes.is/a/UnGfRPlbEeiXdBdbNNxKmQ
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forschungsbezogene Lehr- und Lernformen
Modularer Aufbau => Integration aktueller Beispiele möglich
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barrierefreie, inklusive Lehr- Lernsettings
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individualisierte, kompetenzorientierte Lehr- Lernformate
Einplanung fester Kontingente für "bring your own data/code" in den Workshops
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kollaborative und kooperative Lehr- und Lernformen
Live-Programmierung, OERs & https://hypothes.is/a/hDh4nvlXEeiUM0sV4Sg5vw
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internationale Kooperationen
Carpentries bieten Neuling-freundliche, internationale Gemeinschaft
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Wie müssen digitale Fachkonzepte aussehen, um individuelle (z. B. bessere Chancen auf Erwerbsbeteiligung), organisationale (z. B. höhere Innovationsfähigkeit) sowie gesellschaftliche (z. B. soziale Mobilität) Bildungserträge bzw. -renditen aus tertiärer Bildung zu realisieren?
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Wie müssen digitale Fachkonzepte aussehen, die der Diversität von Studierenden gerecht werden und sie unter Umständen gar positiv nutzen, um erfolgreiches Lernen in heterogenen Zielgruppen im jeweiligen Fach oder der jeweiligen Disziplin zu ermöglichen?
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Wie müssen digitale Fachkonzepte aussehen, um dem Anspruch lebenslangen Lernens unter Einbezug auch non-formalen und informellen Lernens gerecht zu werden?
Einbindung realer Ressourcen in Problemstellungen, Übungen etc. (StackOverflow.com, GitHub.com, etc.)
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Wie müssen digitale Fachkonzepte aussehen, die einen ethischen und reflektiert-kritischen Umgang mit Digitalisierung befördern?
mögliche Quellen: http://www.reproducibleimaging.org/module-FAIR-data/03-Ethics/
- Beispieldatensätze, die "Bauchschmerzen" verursachen, siehe z.B. https://charliepark.org/slopegraphs/#cancer-survival-rates
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bildungs- und hochschulpolitische Herausforderungen und Ziele aufgreifen
Welche? Müsste Projektpartner liefern
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standortübergreifende Zusammenarbeit und der Transfer
OER-Charakter = alle Möglichkeiten
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technologischer Perspektive sollen die aufgegriffenen Technologien nutzerzentriert gestaltet werden, sodass die digitalen Fachkonzepte intuitiv und mit möglichst geringer Lernerunterstützung nutzbar sind
siehe weiter oben
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medienpädagogische und hochschuldidaktische Aspekte
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Promotionsstudien
Carpentries-Fokus, aber kaum Hürden für Jüngere oder Ältere => könnte Forschungsgegenstand werden
- [ ] enthalten Carpentries-Fragebögen das Alter?
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Weiterentwicklung von Lehr- und Prüfungsformaten (formativ/summativ) innerhalb der Fächerkulturen
Carpentries-Standard, mit schon spezifizierten Fachcurricula => solide Basis, Smmlung weiterer Erfahrungen & Optimierung der OERs
Übersetzung möglich
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die digitalen Fachkonzepte auf einzelne Disziplinen bzw. Fächer fokussieren
Nachfolge für MWK-IDN-Projekt?
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so aufgestellt sein, dass durch eine kooperative Zusammenarbeit die unterschiedlichen, konzeptspezifischen Aspekte angemessen erforscht und bearbeitet werden können. Die Konzepte sollten zudem mit wissenschaftlichen Methoden der empirischen Bildungs- und Sozialforschung hinsichtlich ihrer Wirksamkeit abgesichert werden.
Mögliche Schwäche eines Antrags: Carpentries haben schon etabliertes Assessment => müsste entweder kopiert werden, oder Abruf der eigenen Umfragedaten müsste vereinbart werden.
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Kompetenzvermittlung zu erzeugen und hierdurch digitale Fachkonzepte langfristig an den Hochschulen zu verstetigen
Carpentries Instructorausbildung => lokale Teams
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realen Nutzen
auch in Industrie verwendete Technologien
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Erkenntnisse und Beispiele im disziplin- und fachkulturellen Umfeld aufgreifen bzw. aus fachlichen Fragen heraus Problemstellungen weiterentwickeln
https://datacarpentry.org/lessons/ für Bio
https://librarycarpentry.org/lessons/ für Bib/Info (VDB) => In FaMi-Ausbildung oder Informationswissenschaftsstudium integrieren?
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Einbezug digitaler Medien
AUCH: hands-on, "prosumer"
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große Anzahl generalisierbarer und empirisch abgesicherter Erkenntnisse zu Gelingensbedingungen sowie Beispielen guter Praxis einer erfolgreichen Lehre
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- Oct 2018
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librarycarpentry.github.io librarycarpentry.github.io
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understand how the code or writing came to be,
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- Aug 2018
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www.mwk.niedersachsen.de www.mwk.niedersachsen.de
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Bildungsmaterialien zur Verfügung gestellt werden
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- Jul 2018
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www.mwk.niedersachsen.de www.mwk.niedersachsen.de
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OER-Portal
Materialien sind in technisch standardisierten Formaten erstellt (Markdown, HTML, R- & Python-Code, etc.) und können problemlos in anderen Plattformen als PDF oder ZIP archiviert werden (bisher: Website <= GitHub => Zenodo).
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hohe Zahl an Materialien zu erreichen
sind schon vorhanden => Fokus auf collaborative Anpassung an lokale Gegebenheiten/Wünsche/Beispiele
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selbstgesteuertes und/oder forschendes Lernen
Carpentries lessons können auch selbst durchgearbeitet werden, und im flipped classrom mit den Instructors nachbereitet.
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Internationalisierung
an Community teilnehmen & Carpentry Instructors einladen
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- May 2018
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f1000research.com f1000research.com
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4. Define clear and transparent contribution, governance and communication processes
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3. Adopt a licence and comply with the licence of third-party dependencies
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2. Make software easy to discover by providing software metadata via a popular community registry
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1. Make source code publicly accessible from day one
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- Mar 2018
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www.wias-berlin.de www.wias-berlin.de
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- Gummel mapping/method
- the part about machine-executed proofs sounds like https://media.ccc.de/v/34c3-9105-coming_soon_machine-checked_mathematical_proofs_in_everyday_software_and_hardware_development
- "semantic TeX" => CTAN package?
- OMDoc
- sTeX
- MMT
- TGView
- MPD Viewer
- OpenDreamKit = domain-specific language?
- MaMoReD
Tags
Annotators
URL
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www.wias-berlin.de www.wias-berlin.de
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- R/(gg)plots visualise => linguists detect interesting phenomena to analyse further
- Wang2Vec: train backprogagation network
Tags
Annotators
URL
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- Feb 2018
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swcarpentry.github.io swcarpentry.github.io
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log --patch
same as
git show
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We could also use git show which shows us what changes we made at an older commit as well as the commit message, rather than the differences between a commit and our working directory that we see by using git diff.
show
as in "show me what I did"diff
as in "difference between working directory and ..."
Tags
Annotators
URL
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swcarpentry.github.io swcarpentry.github.io
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wc -l $(find . -name '*.txt')
find . -name '*.txt' | wc -l
would return 4, which is the number of lines in find's stdout, not in each of its results.
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www.biorxiv.org www.biorxiv.org
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Compact
Main reason for compactness over for example DOI?
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1) a unique prefix or namespace indicating the assigning authority and 2) a locally assigned database identifier
Same as DOI, no?
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os.helmholtz.de os.helmholtz.de
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offener, etablierter und z. B. durch die Open Source Initiative (OSI) anerkannter Lizenzen wird empfohlen
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Checklisten
Manuelle, oder Tools wie z.B. auf https://github.com/marketplace/ zu finden?
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Softwaremanagementplänen
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ermöglicht werden, Software unter Nutzung von Digital Object Identifiers (DOIs) und anderen Persistent Identifiers (PIDs) zu veröffentlichen
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Innerhalb des Zentrums sollte ein kollaborativer Zugang zur Förderung von Synergien12 und des interdisziplinären Austauschs ermöglicht werden
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gesamte Lebenszyklus von Software-Projekten
Die Strategie von GitLab passt hierzu, auch langfristig
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Sichtbarmachung
GitLab-Instanzen öffentlich schalten & Pages aktivieren
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Einbindung des Programmcodes in Software Dritter
möglicherweise sind hierfür "dependency management"-Werkzeuge nutzbar
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Metriken
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Wissenschaftliche Software an Forschungseinrichtungen
Hier würde eigenes Quellcodehosting helfen, oder institutionelle Zugänge zu den populären Quellcodehostingplattformen.
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mangelt es hierfür an Standards, Leit- und Richtlinien sowie Best Practices
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- Jan 2018
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- observation: new people come into community, discuss new ideas, discussion dies down
- but we also look at these new tech & discuss their applicability
- "phone" is identified by several IDs
- hashes talk about accession, not about for example location
- CIIDRA = IDs for construction industry
- "immutability" in programming isn't necessarily useful for persistence
- issues with DOI: What does it mean to "own" an identifier?
- DOIs can be handed over to other organisation
- ownership is multi-faceted: content, domain, infrastructure to keep it available, etc.
- same for "trust": intention vs. execution
- "distributed": membership organisations, server locations, decision taking
- efforts of hacking around social issues are doomed
- governance needs human interaction
- blockchain for PIDs is antisocial & elitist
- observation: new people come into community, discuss new ideas, discussion dies down
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- aligning incentive between policy creator & follower needed, like in Hamurabi's code
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- data silos: maybe we know them, but like a city covered by fog, we can't easily look deeply => solution ideas: NCATS Data Translator Knowledge Map
- How many FTEs are spend reconciling IDs from different sources?
- [ ] considered packaging & publishing scripts to avoid re-scripting?
- no qualifiers for relatedTo means merging opposing data becomes common
- something similar to https://github.com/pandoc-scholar/pandoc-scholar#semantic-citations needed
- instead: https://github.com/monarch-initiative/kboom
- http://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.2001414
- [ ] Why PIDs needed for licenses? creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0 is URL & ID in one, no?
- http://reusabledata.org/
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- difficult to calculate impact / ROI of big scientific machinery
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- p hacking or "garden of forking paths" washes random cases of significances up as scientific findings
- remedy: pre-registering studies & methods
- allTrials in medicine, now social sciences
- discussion at BITSS: which PIDs to use?
- pre-registrars require rather many fields, compared to repositories
- still, people do fill these out => several hundred studies pre-registered each
- sounds like RIOjournal, but community-owned registrars have better reputation there => better to introduce PIDs there, than to introduce them to new journal
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- conference acronyms not unique
- some conferences don't have publishers
- some are predatory / fake / mock
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- audience consensus: little discussion necessary about whether blogs should have DOIs, concrete implementations needed
- manual DOI registration possible, but of little use
- API call better, but integration from blogging software necessary
- SEO also requires exposing metadata => interests align
- schema.org/BlogPosting suggested
- https://blog.datacite.org/ uses JSON-LD
- https://wordpress.org/plugins/schema/
- sitemap needed so that indexer can find the posts to then extract metadata
- beta testers from institutions that already register DOIs welcome
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pidapalooza18.sched.com pidapalooza18.sched.com
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- building tech, syntax & metadata is comparatively easy
- How to create social context for acceptance of identifiers?
- [ ] But why was that possible for several PIDs, but not for keeping URLs stable in the first place?
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- Dec 2017
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blogs.tib.eu blogs.tib.eu
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searchable indexes
Platform search is a given in any case, no? GitHub, GitLab, dedicated code searches. Not on CRAN.
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describe each dataset carefully and as completely as possible with metadata
set GitHub Topics
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who collected / edited / published
git log & blame
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domain-relevant community standards
- Code style guides, (auto) linters, etc.
- TDD, BDD and other development models
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Provenance information
Definitely codemeta.json, but also Git's blame view?
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how reliable it is
derive from semver.org => 1>v = unstable, then each major release may break API
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legal conditions
LICENSE file, based on ChooseALicense.com, tldrLegal.com, licenses.opendefinition.org or opensource.org/licenses.
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DOI
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contains complementary information of another dataset, this must be specified in the (meta)data
for software: inclusion of external libraryies or dependencies is usually specified in header files, on top of code files, in DESCRIPTION (R package), by
import
or::
statements.Since source code can be indexed like text, does it have to be repeated in metadata? GitHub & other services seem to already do that: github.com/blog/2470
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domain-based mappings may help to develop a common understanding
How about domain-specific programming languages? Does they faciliate common understanding or do they separate concerns? Or "and" in case of the DSL engineer who bridges the gap on behalf of the users?
- [ ] Listen again to omegataupodcast.net/228
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vocabularies / ontologies
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interpreted
More difficult, because compiler & helper tools may be necessary.
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exchanged
Probably only easy for software only when refering to source code in text files.
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identifying the PID in the metadata
Idea for R packages: download example data based on ID in metadata, in addition to including the .rda in the package.
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PID
Can an intrinsic identifier like a SHA result serve as that? Changes over time = changed SHA, but old SHAs still ID the old versions.
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- Nov 2017
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www.wias-berlin.de www.wias-berlin.de
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additional dimension may be of course time, but also any other changing parameter suchas voltage or current or the change of material or geometric parameters
Like in Grammar of Graphics: mapping data to scales
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datascience.codata.org datascience.codata.org
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open standard Media Fragment Identifier (MFID)
also used by https://podlove.org/deep-link/ :-)
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number of views or downloads
Which scientifically sound approaches exist for measuring these? Seems like a case of Campbell's law...
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hal.archives-ouvertes.fr hal.archives-ouvertes.fr
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it
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SHA1 cryptographichash [7] is the most used approach for computing them today. eclear advantage of crypto-hard intrinsic identiers
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then
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a single points
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analyzethe whole body of publicly available source code
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www.degruyter.com www.degruyter.com
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wich
h
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the creation a new author
of
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each reviewer does not see the comments of the other reviewers
Would an open or post-publication peer review process also be technically possible?
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introduce no new security flaws
In principle or in practice? Every software component can have bugs, and some of those may be security-relevant. Do the authors maybe mean "no new known security vulnerabilities"?
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Support the import of manuscripts in widely used formats such as Microsoft Word. This is crucial to attract authors with a background of using different authoring systems, as it enables them to continue working on manuscripts they have started drafting outside of our integrated environment.–The system needs to be able to export to a variety of formats, such as Microsoft Word, PDF and LaTeX. This is important to support the publishing workflows of as many publishers as possible.–Support widely used conference and journal publishing templates and layouts
pandoc in back-end?
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ARPHA authoring tool does not support realtime collaborative editing
More comparable to Git than to EtherPad, Google Docs etc.?
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unclean format where the semantics are open to interpretation is a major problem for publishers
Yet, how many / which ones are offering up-to-date .tex or similar templates?
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constructive feedback
in FLOSS: pull/merge request is most constructive (implement desired changes yourself, and suggest inclusion)
How about giving reviewers the ability to edit the doc (with changes tracked like in Word)?
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